Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AatfQ9JKX4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms