Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Extl1Q9JKV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Extl1Q9JKV7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms