Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lactb2Q99KR3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lactb2Q99KR3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms