Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn13Q64512 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn13Q64512 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms