Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacs2Q3V3Q7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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