Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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