Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 NOP53YPL146C 1368 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 FAA1YOR317W 2103 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YDR341CYDR341C 1824 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 GUP1YGL084C 1683 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 RIA1YNL163C 3333 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 RPS17BYDR447C 411 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YGL024WYGL024W 336 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 RPL20BYOR312C 519 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 TAF5YBR198C 2397 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 SLM2YNL047C 1971 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 PWP2YCR057C 2772 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 DOT6YER088C 2013 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 SWC7YLR385C 399 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 POL1YNL102W 4407 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 VHS3YOR054C 2025 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YGL069CYGL069C 465 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YGR022CYGR022C 330 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YMR324CYMR324C 243 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YOR218CYOR218C 420 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 HFM1YGL251C 3564 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 HEH2YDR458C 1992 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 IPT1YDR072C 1584 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 PMC1YGL006W 3522 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YOL075CYOL075C 3885 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 PIM1YBL022C 3402 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 KEL2YGR238C 2649 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 GAL11YOL051W 3246 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 HSC82YMR186W 2118 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 RSC1YGR056W 2787 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YLR416CYLR416C 399 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 ACM1YPL267W 630 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 snR191snR191 274 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 KAR3YPR141C 2190 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 COS111YBR203W 2775 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 MCM10YIL150C 1716 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 RIX1YHR197W 2292 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 LYS2YBR115C 4179 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 PRE4YFR050C 801 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 GAT4YIR013C 366 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 YBR277CYBR277C 402 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 PLC1YPL268W 2610 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1A-BRQ12217 TFC8YPL007C 1767 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 PHO8YDR481C 1701 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YER053C-AYER053C-A 114 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 ISA1YLL027W 753 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 RPB10YOR210W 213 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 DUF1YOL087C 3351 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 ABP140YOR239W 1887 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YEL043WYEL043W 2871 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 IOC2YLR095C 2439 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 RAD1YPL022W 3303 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 MET4YNL103W 2019 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 LSO2YGR169C-A 279 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YPR014CYPR014C 330 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 VID27YNL212W 2349 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YCF1YDR135C 4548 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 TEL1YBL088C 8364 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YLR282CYLR282C 342 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 FOX2YKR009C 2703 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 PDR5YOR153W 4536 nt4□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 RNR1YER070W 2667 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 SIR3YLR442C 2937 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 CIN1YOR349W 3045 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 GIN4YDR507C 3429 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 RAM2YKL019W 951 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YBL065WYBL065W 345 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YOR345CYOR345C 351 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 EFR3YMR212C 2349 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 APC11YDL008W 498 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YDR193WYDR193W 399 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 YOR333CYOR333C 417 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 RPS23BYPR132W 438 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 OM14YBR230C 405 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 CPA2YJR109C 3357 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 COG3YER157W 2406 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 ELG1YOR144C 2376 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 PAN3YKL025C 2040 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1A-BRQ12217 COY1YKL179C 2040 nt3.97□□□□□ -1.77
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