Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc8E9PWG2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms