Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r17Q9Z2E4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r17Q9Z2E4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r17Q9Z2E4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp1r17Q9Z2E4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r17Q9Z2E4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r17Q9Z2E4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms