Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pf4Q9Z126 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pf4Q9Z126 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pf4Q9Z126 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pf4Q9Z126 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pf4Q9Z126 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pf4Q9Z126 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pf4Q9Z126 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pf4Q9Z126 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pf4Q9Z126 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pf4Q9Z126 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms