Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd97Q9Z0M6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd97Q9Z0M6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd97Q9Z0M6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd97Q9Z0M6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd97Q9Z0M6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd97Q9Z0M6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd97Q9Z0M6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd97Q9Z0M6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd97Q9Z0M6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd97Q9Z0M6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd97Q9Z0M6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms