Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Katna1Q9WV86 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Katna1Q9WV86 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Katna1Q9WV86 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Katna1Q9WV86 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Katna1Q9WV86 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms