Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept6Q9R1T4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept6Q9R1T4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept6Q9R1T4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept6Q9R1T4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sept6Q9R1T4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sept6Q9R1T4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms