Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NrkQ9R0G8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NrkQ9R0G8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NrkQ9R0G8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NrkQ9R0G8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NrkQ9R0G8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NrkQ9R0G8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NrkQ9R0G8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
NrkQ9R0G8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NrkQ9R0G8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NrkQ9R0G8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NrkQ9R0G8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
NrkQ9R0G8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.05■■■■■ 4
NrkQ9R0G8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
NrkQ9R0G8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NrkQ9R0G8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NrkQ9R0G8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
NrkQ9R0G8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NrkQ9R0G8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NrkQ9R0G8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NrkQ9R0G8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms