Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exo1Q9QZ11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exo1Q9QZ11 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exo1Q9QZ11 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo1Q9QZ11 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Exo1Q9QZ11 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exo1Q9QZ11 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms