Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcsk1nQ9QXV0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcsk1nQ9QXV0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcsk1nQ9QXV0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcsk1nQ9QXV0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcsk1nQ9QXV0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcsk1nQ9QXV0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms