Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdc42ep4Q9JM96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdc42ep4Q9JM96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdc42ep4Q9JM96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdc42ep4Q9JM96 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdc42ep4Q9JM96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms