Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AatfQ9JKX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AatfQ9JKX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AatfQ9JKX4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AatfQ9JKX4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AatfQ9JKX4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AatfQ9JKX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AatfQ9JKX4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms