Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfhx4Q9JJN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfhx4Q9JJN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfhx4Q9JJN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.9 ms