Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aldh1a3Q9JHW9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Aldh1a3Q9JHW9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh1a3Q9JHW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aldh1a3Q9JHW9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh1a3Q9JHW9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms