Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Senp3Q9EP97 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Senp3Q9EP97 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Senp3Q9EP97 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Senp3Q9EP97 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Senp3Q9EP97 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Senp3Q9EP97 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Senp3Q9EP97 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Senp3Q9EP97 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms