Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift43Q9DA69 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift43Q9DA69 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift43Q9DA69 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift43Q9DA69 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ift43Q9DA69 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift43Q9DA69 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms