Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Llcfc1Q9D9P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Llcfc1Q9D9P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Llcfc1Q9D9P8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Llcfc1Q9D9P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Llcfc1Q9D9P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Llcfc1Q9D9P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Llcfc1Q9D9P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Llcfc1Q9D9P8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms