Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Chic2Q9D9G3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Chic2Q9D9G3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Chic2Q9D9G3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Chic2Q9D9G3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Chic2Q9D9G3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Chic2Q9D9G3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Chic2Q9D9G3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Chic2Q9D9G3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Chic2Q9D9G3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Chic2Q9D9G3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Chic2Q9D9G3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Chic2Q9D9G3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Chic2Q9D9G3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Chic2Q9D9G3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Chic2Q9D9G3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Chic2Q9D9G3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Chic2Q9D9G3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Chic2Q9D9G3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Chic2Q9D9G3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms