Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alkbh4Q9D8F1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alkbh4Q9D8F1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alkbh4Q9D8F1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alkbh4Q9D8F1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alkbh4Q9D8F1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms