Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl4Q9D8E6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl4Q9D8E6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl4Q9D8E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpl4Q9D8E6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpl4Q9D8E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl4Q9D8E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl4Q9D8E6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms