Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vstm5Q9D806 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm5Q9D806 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm5Q9D806 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vstm5Q9D806 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm5Q9D806 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms