Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip1Q9D620 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rab11fip1Q9D620 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip1Q9D620 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip1Q9D620 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab11fip1Q9D620 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rab11fip1Q9D620 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab11fip1Q9D620 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab11fip1Q9D620 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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