Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata1Q9D5R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spata1Q9D5R4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spata1Q9D5R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spata1Q9D5R4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spata1Q9D5R4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spata1Q9D5R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms