Protein–RNA interactions for Protein: Q9D486

Cmip, C-Maf-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CmipQ9D486 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CmipQ9D486 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CmipQ9D486 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CmipQ9D486 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CmipQ9D486 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CmipQ9D486 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CmipQ9D486 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CmipQ9D486 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CmipQ9D486 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CmipQ9D486 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CmipQ9D486 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CmipQ9D486 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CmipQ9D486 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CmipQ9D486 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CmipQ9D486 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CmipQ9D486 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CmipQ9D486 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CmipQ9D486 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CmipQ9D486 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CmipQ9D486 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CmipQ9D486 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CmipQ9D486 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CmipQ9D486 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CmipQ9D486 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CmipQ9D486 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CmipQ9D486 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CmipQ9D486 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms