Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UvssaQ9D479 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UvssaQ9D479 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UvssaQ9D479 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UvssaQ9D479 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UvssaQ9D479 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UvssaQ9D479 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UvssaQ9D479 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UvssaQ9D479 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UvssaQ9D479 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms