Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx29Q9D3S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx29Q9D3S3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx29Q9D3S3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx29Q9D3S3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx29Q9D3S3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx29Q9D3S3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx29Q9D3S3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx29Q9D3S3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx29Q9D3S3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx29Q9D3S3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snx29Q9D3S3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx29Q9D3S3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 526.9 ms