Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYS6

Uncharacterized protein C2orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYS6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CYS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYS6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9CYS6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CYS6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYS6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CYS6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYS6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CYS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYS6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYS6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms