Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Filip1Q9CS72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Filip1Q9CS72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Filip1Q9CS72 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Filip1Q9CS72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Filip1Q9CS72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Filip1Q9CS72 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Filip1Q9CS72 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Filip1Q9CS72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms