Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Txndc9Q9CQ79 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Txndc9Q9CQ79 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Txndc9Q9CQ79 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Txndc9Q9CQ79 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txndc9Q9CQ79 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Txndc9Q9CQ79 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Txndc9Q9CQ79 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms