Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pramel1Q99MW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pramel1Q99MW3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramel1Q99MW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramel1Q99MW3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramel1Q99MW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramel1Q99MW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pramel1Q99MW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pramel1Q99MW3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms