Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtpbp4Q99ME9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtpbp4Q99ME9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtpbp4Q99ME9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtpbp4Q99ME9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtpbp4Q99ME9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms