Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan1Q99J59 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan1Q99J59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan1Q99J59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan1Q99J59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan1Q99J59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan1Q99J59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan1Q99J59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms