Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurl1Q923S6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurl1Q923S6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Neurl1Q923S6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1Q923S6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Neurl1Q923S6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurl1Q923S6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms