Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atl3Q91YH5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atl3Q91YH5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atl3Q91YH5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atl3Q91YH5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atl3Q91YH5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atl3Q91YH5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atl3Q91YH5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms