Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha8Q91Y12 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha8Q91Y12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha8Q91Y12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha8Q91Y12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha8Q91Y12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms