Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac11Q91WA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac11Q91WA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac11Q91WA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac11Q91WA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac11Q91WA3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac11Q91WA3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms