Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdrd3Q91W18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tdrd3Q91W18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdrd3Q91W18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdrd3Q91W18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tdrd3Q91W18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tdrd3Q91W18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tdrd3Q91W18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tdrd3Q91W18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tdrd3Q91W18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms