Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r22Q8R2D1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r22Q8R2D1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r22Q8R2D1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r22Q8R2D1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r22Q8R2D1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r22Q8R2D1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r22Q8R2D1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r22Q8R2D1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms