Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2A8

Alg3, Dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,3-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg3Q8K2A8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Alg3Q8K2A8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Alg3Q8K2A8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alg3Q8K2A8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alg3Q8K2A8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Alg3Q8K2A8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Alg3Q8K2A8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Alg3Q8K2A8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Alg3Q8K2A8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Alg3Q8K2A8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.9 ms