Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc4a8Q8JZR6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Slc4a8Q8JZR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc4a8Q8JZR6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc4a8Q8JZR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc4a8Q8JZR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a8Q8JZR6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc4a8Q8JZR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms