Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Card11Q8CIS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Card11Q8CIS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Card11Q8CIS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Card11Q8CIS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Card11Q8CIS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Card11Q8CIS0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Card11Q8CIS0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Card11Q8CIS0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Card11Q8CIS0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Card11Q8CIS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Card11Q8CIS0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Card11Q8CIS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Card11Q8CIS0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms