Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CopaQ8CIE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CopaQ8CIE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CopaQ8CIE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CopaQ8CIE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CopaQ8CIE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms