Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI51

Pdlim5, PDZ and LIM domain protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim5Q8CI51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdlim5Q8CI51 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim5Q8CI51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim5Q8CI51 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim5Q8CI51 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim5Q8CI51 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdlim5Q8CI51 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim5Q8CI51 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdlim5Q8CI51 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim5Q8CI51 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim5Q8CI51 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim5Q8CI51 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms