Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDY9

Pcdhb7, Protocadherin beta 7, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb7Q8CDY9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb7Q8CDY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb7Q8CDY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb7Q8CDY9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb7Q8CDY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb7Q8CDY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb7Q8CDY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb7Q8CDY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdhb7Q8CDY9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdhb7Q8CDY9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb7Q8CDY9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms